1. Construction of antisense cDNA library
2. Plant transformation
3. Selection of transgenic plants
4. Screening of mutants
5. Isolation of insert cDNA
6. Analysis of sequencing data for insert cDNA
7. Plant retransformation

필수 유전자의 기능성 동정에 다른 기능성 유전체 연구보다 많은 장점을 가진다.
변이체의 표현형이 우성으로 발생 초기에 쉽게 변이체를 동정할 수 있다.
cf. insertional mutagenesis는 변이체의 표현형이 열성으로 나타남.
Multigene family에서도 in vivo 상태로 특정 유전자의 기능을 동정할 수 있다.
필수 유전자의 antisense disruption은 변이체의 회복되지 않는 치사를 이끌 것이다. 그러므로 inducible vector의 사용이 필수적이다.
Simple PCR method를 통하여 쉽게 유전자를 clone할 수 있다.